上海医疗器械高等专科学校由中央卫生部于1960年创建，1981年起先后转由国家医药管理局和药品食品监督管理局领导，2000年学校划转到上海市，实行中央与地方共建，以上海市政府管理为主。2003年5月，经上海市政府批准，上海医疗器械高等专科学校划归上海理工大学管理，组建上海理工大学医疗器械学院，同年7月正式挂牌。目前实行“一套班子、两块牌子”的管理模式，依托上海理工大学的办学条件和学科建设的优势进行医疗器械和制药工程本专科专业的招生和教学，实现了由专科教育到本科教育的跨越式的发展。学院（校）是目前国内唯一一所专门培养医疗器械和药剂设备工程技术人才的高等院校，并承担着全国医疗器械行业和制药机械行业专业技术人员的培养和进修任务。目前，学院（校）在职在编教职工298人，其中专任教师131名，占教职工总数的44%。正、副教授51名，占38.9%，具有博、硕士学位教师共65名，占49.6%。学院（校）占地面积约60000M2，校舍面积82000M2。拥有生物医学工程中心实验室、医疗器械工程中心实验室、医学影像工程中心实验室等10个专业实验室，实习工厂1所；拥有计算中心、电化教育中心、语音实验室、多媒体教室、实习实训中心，并建有较现代化的大型计算机房和校园网；校外签约实习基地30余个。图书馆藏书18万册，各类期刊600余种。目前，学院（校）本科开设4个专业6个方向，分别为“生物医学工程”专业（下设医用电子仪器、医用信息系统2个专业方向）、“医疗器械工程”专业（下设精密医疗器械、医疗器械检测技术2个专业方向）、医学影像工程和“药物制剂”（药剂设备方向）专业。本科在校生规模已达1000余人。专科专业开设医用电子仪器、精密医疗器械、医学影像设备、临床工程技术、医疗器械检测技术、药剂设备、市场营销（医疗器械营销）等18个专业及专业方向。专科在校生规模达4000余人。45年的办学历史，学院（校）形成了理、工、医结合、以工为主、兼容管理，培养特色显著的工程应用型人才的办学特色；形成了职业针对性明确，通过产学研结合的办学模式，职前职后共举的办学方针，错位竞争的办学思路，培养适应市场需要的工程技术应用型人才的办学特点；形成了培养学生成为理工医结合，以工为主，懂得管理，有相关国际知识背景，现代工程技术应用能力强，具有以务实和创新为核心的精神风貌和素质特点的医工结合的应用型人才的培养目标。学院（校）办学定位为教学科研型。以培养工程应用型本科人才为主要任务，适量招收硕士研究生。 学院（校）科研以医疗器械和医学基础研究、临床应用研究、生物技术研究和生命科学研究的交叉应用研究为切入点，尽快跨入中、高端研究领域；以产学研合作研究为主要组织形式，始终把握产业化、市场化导向，并坚持走国内高起点合作和国际合作研究的道路。学院（校）近年来先后接待和邀请来自美国、日本、德国、挪威、越南等国的专家、教授来校访问、交流、讲学，合作办学等，活跃了学校学术气氛，建立了联系渠道，扩大了学术视野，促进了学院（校）各专业的学科建设与发展。近三年学生就业率在95%以上，受到用人单位的欢迎和好评。目前，医疗器械学科已被列为上海市重点建设学科和医疗器械教育高地建设项目。学院（校）办学目标是要将医疗器械学科建设成为国内一流学科，办成在医疗器械行业内有重要影响的高水平学院（校）。